小型冷凍干燥機應用的真空冷凍干燥技術，簡稱凍干，又稱升華干燥。廣泛應用于藥品、生物制品、化工及食品工業。對熱敏性物質如抗生素、疫苗、血液制品、酶激素及其他生物組織，凍干技術非常適用。
小型冷凍干燥機還用在醫學、制藥、生物研究和生物制藥、中藥材、西藥針劑等領域。經冷凍干燥處理的藥品易于長期保存，加水后能恢復到凍干前狀態并保持原有生化特性。制藥冷凍干燥機可用于血清、血漿、疫苗、酶、抗生素、激素等藥品的生產；由于真空冷凍干燥具有其它干燥方法沒有的優點，因此該制藥技術受到人們的青睞，在醫藥的應用已日益廣泛，真空冷凍干燥技術也為保存生物活性提供了良好的解決途徑。
小型冷凍干燥機還用于生物制品的冷凍干燥，產品要求有一定的物理形態、均勻的顏色、合格的殘水含量、良好的溶解性、高的存活率或效價、長的保存期。因此不僅要對原材料的配制和凍干后的密封保存進行控制，更重要的是對凍干過程每一階段各參數進行全面監控，以獲得良好的凍干產品。
凍干過程的參數主要是溫度、壓強和時間三要素，即預凍階段、升華階段、解吸階段三個階段。在預凍階段過程中，一般采用速凍對物料進行凍結,所產生的冰晶體較小,在升華過程中較易除去。采用在長時間慢凍工藝(時間≥10- 12h) 下預凍，在低工作壓力(≤20Pa)、低升華溫度（≤25C)下進行物料的升華干燥。物料在低溫下進行干燥，冰晶迅速的升華,縮短了升華干燥時間；采用較高的解吸溫度(≥50C )，縮短了解吸干燥的時間,降低了含水量。確定冷凍干燥參數的主要依據是產品的品種和凍干機的性能，其次也要考慮到總裝量，每瓶內的裝量和厚度、容器的種類，產品是放在盤內干燥還是直接放在板層上干燥，瓶口是否帶有塞子等。
